比特小隊游戲中的一些關卡地圖中有著一些隱藏關卡！有些隱藏關卡需要達到特定的條件才會開放！不過一些隱藏關卡的前提條件是需要先開啟平行宇宙！

昆雅幻境

在1-1中玩家不主動攻擊敵怪，撿完地圖內的所有箱子后，到符文陣處直接傳送。

進入條件 不傷害1-1內怪物撿完所有箱子 走到傳送陣上即可

隱藏關傳送陣有隱藏解鎖條件 條件未知

我新號沒有傳送門 應該是通關一次正常宇宙

變異洞穴

在2-1昏暗洞穴玩家有機會遇到一個手拿三角形的怪，不打他，等他將手中的三角形放置在地上即可，那個三角形就是去隱藏關的。

進入條件 隨機在2關碰見盜寶怪 等他丟傳送門 進入即可

只在平行宇宙碰到的隱藏關 出現(xiàn)條件為無傷通過平行宇宙2-1

政府軍飛船

在3-1中玩家會隨機遇到一個停機場，會有飛船降落，靠近飛船互動就可以傳送去隱藏關了，在?-2玩家可以遇到隱藏boss大將斯梅爾。

進入條件 在3-1碰見飛過來的飛船 走進互動即可進入

在-2將會碰到隱藏boss 大將 斯梅爾

平行宇宙

玩家首先要通關一次，然后第二次在打到boss前的房間內，跟里面的電腦互動，然后清怪打完boss后，玩家們就會進入二周目了，二周目的難度較大，且最終boss改為第三形態(tài)。